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日本时代台湾总督府於1897年规定鸦片专卖，并陆续将樟脑（1899年）、食盐（1899年）、菸草（1906年）、酒（1922年）等纳入专卖事业。「台湾总督府专卖局台北南门工场」创建於1899年，为制造及试验樟脑、鸦片等两大专卖品的重要生产基地，1901年改称南门工场，1931年再改名为台北南门工场，是日本时代台湾唯一的公营樟脑加工厂。

战後本工场由政府接收，1947年二二八事件後，台湾专卖（公卖）业务缩减为菸、酒、樟脑三项，本工场於1952年改称台湾省樟脑炼制厂、1956年再改名为台湾省樟脑厂。1967年12月樟脑开放民营，本工场遂停工废厂。今日建筑物仅有物品仓库（小白宫）、樟脑仓库（红楼）和四百石贮水槽，现存基地面积不及日治时期的八分之一。

1998年，南门工场由内政部指定为国定古蹟，2004年起台湾博物馆配合文化部（原行政院文化建设委员会）首都文化园区计画，建构「台湾博物馆系统」，将都市中的历史空间整顿再利用为博物馆空间。2006年本工场土地建物由国有财产局拨交台湾博物馆，将古蹟建筑物再利用为展示馆并新建一栋典藏库房，由詹益忠建筑师事务所负责修复再利用之规划设计。本工场修复过程宛如建筑历史的解剖，涉及建筑设计、结构、机电设备、保存、考古、传统工艺、历史和工程等专业领域合作。