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大佳码头位於圆山基隆河左岸，圆山昔称圆仔山，是大龙峒地形上的龙头之地，由於基隆河流经，过去曾是海水进出的湖沼地区，经过开挖发掘的圆山遗址及贝塚，证明当时先民生活的位址。紧依着圆山的剑潭之地，因国姓爷郑成功插剑水潭取水而得名，日据时期日人曾於今圆山饭店旁忠烈祠西侧之地，兴建台湾神社及神宫外苑花园，由此可见其地理位置之重要性。

大佳码头位於基隆河南岸、大直桥以西约200公尺的地方。这里是「蓝色水路」的游艇码头，从这里有大佳到圆山、大佳到内湖科学园区单点来回两个航线。